Sono aperte le iscrizioni per il corso “Dinamica Classica per simulazione di sistemi biologici” (Dott. Alessandro Grottesi, Dott. Giordano Mancini, Dott. Giovanni Chillemi) che si svolgera’ dal 22 al 24 Febbraio presso il CASPUR (Sala Auditorium, Via dei Tizii 2c, Roma).
Il corso si propone di fornire fornire gli strumenti teorici e pratici per eseguire simulazioni di dinamica molecolare classica di macromolecole biologiche, Verranno presentate in particolare le nozioni di base per l’uso pratico del software di dinamica molecolare Gromacs e gli strumenti per lanalisi delle traiettorie delle simulazioni ottenute con gli strumenti di calcolo parallelo del CASPUR.
Al termine del corso lo studente/utente sara’ in grado di progettare/eseguire calcoli HPC di Dinamica Molecolare nell’ambiente di calcolo parallelo del CASPUR (sia su cluster CPU che GPU) e di analizzare i relativi dati in ambiente UNIX/Linux.
E’ richiesta:
* Nozioni di base di ambiente Unix/Linux.
Per iscriversi e’ necessario compilare il form alla sezione “Iscrizione” della pagina del corso
(http://corsihpc.caspur.it/Dinamica_Molecolare_classica_per_la_simulazione_di_sistemi_biologici)
Cogliamo quest’occasione per ricordare il calendario dei corsi organizzati dal CASPUR per il 2011: (http://corsihpc.caspur.it)
* 15 – 18 Marzo 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio C
* 21 – 24 Marzo 2011: Project_Management
* 29 – 31 Marzo 2011: Tool per la scrittura, sviluppo e gestione del software scientifico
* 19 – 21 Aprile 2011: Introduzione all’amministrazione di sistemi Linux-Workstation
* 3 – 6 Maggio 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio Fortran95
* 17 – 19 Maggio 2011: Introduzione al calcolo parallelo con MPI e OpenMP
* 31 Maggio – 1 Giugno 2011: Analisi serie storiche con AdamSotf
* 7 – 9 Giugno 2011: Matlab per il calcolo scientifico
* 29 Agosto – 9 Settembre: Scuola Estiva di Calcolo Avanzato
* 20 – 22 Settembre 2011: Introduzione all’amministrazione di sistemi Linux-Server
* 27 – 29 Settembre 2011: Database per la ricerca biomedica
* 4 – 6 Ottobre 2011: Tecniche di Data Mining per la classificazione
* 18 – 20 Ottobre 2011: Networking
* 25 – 27 Ottobre 2011: Scripting in Python
* 2 – 4 Novembre 2011: GPU programming
* 15 – 17 Novembre 2011: Elementi di amministrazione di un sistema Windows Server
* 29 Novembre – 2 Dicembre 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio C++
